این صندوق به عنوان تنها نهاد تخصصی تأمین مالی شرکت‌های دانش‌بنیان کشور، بیش از ۹۰ خدمت را در چهار دسته تسهیلات، ضمانت‌نامه، سرمایه‌گذاری و توانمندسازی به دانش‌بنیان‌ها ارائه می‌کند.
با توجه به افزایش تعداد شرکت‌های دانش‌بنیان و به تبع آن افزایش نیازمندی‌های این شرکت‌ها، صندوق نوآوری و شکوفایی تلاش کرده است علاوه بر منابع داخلی، از شبکه همکاران خود در زیست‌بوم فناوری کشور شامل شبکه بانکی و بازار سرمایه برای تأمین مالی دانش‌بنیان‌ها و کمک به رشد و توسعه روزافزون زیست‌بوم استفاده کند.
استفاده از ظرفیت بازار سرمایه، گامی مهم در تسهیل دسترسی شرکت‌های دانش‌بنیان بزرگ به منابع مالی محسوب می‌شود.
در همین راستا، تأمین مالی ۱۰۰ میلیارد تومانی شرکت دانش‌بنیان پارسا پلیمر شریف از طریق انتشار اوراق مرابحه در بازار فرابورس ایران به‌منظور تأمین سرمایه در گردش شرکت، با ضمانت صندوق نوآوری و شکوفایی انجام شد.
اوراق مرابحه منتشرشده (مرداد ماه ۱۴۰۴) با ضمانت صندوق نوآوری و شکوفایی، دارای سررسید ۳ ساله، نرخ سود سالانه ۲۳ درصد و پرداخت سود به‌صورت سه‌ماهه است. بازپرداخت اصل مبلغ نیز در پایان دوره انجام خواهد شد.
